Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tarbp1E9Q368 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tarbp1E9Q368 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms