Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Pdzd2E9Q1M1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Pdzd2E9Q1M1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Pdzd2E9Q1M1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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