Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Myo5cE9Q1F5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
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