Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Krt78E9Q0F0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Krt78E9Q0F0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt78E9Q0F0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt78E9Q0F0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt78E9Q0F0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms