Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms