Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms