Protein–RNA interactions for Protein: E9PWJ7

Abca16, ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca16E9PWJ7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Abca16E9PWJ7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Abca16E9PWJ7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Abca16E9PWJ7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Abca16E9PWJ7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Abca16E9PWJ7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Abca16E9PWJ7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Abca16E9PWJ7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Abca16E9PWJ7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Abca16E9PWJ7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Abca16E9PWJ7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Abca16E9PWJ7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Abca16E9PWJ7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Abca16E9PWJ7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Abca16E9PWJ7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Abca16E9PWJ7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Abca16E9PWJ7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abca16E9PWJ7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abca16E9PWJ7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abca16E9PWJ7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abca16E9PWJ7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Abca16E9PWJ7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abca16E9PWJ7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abca16E9PWJ7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abca16E9PWJ7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abca16E9PWJ7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abca16E9PWJ7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abca16E9PWJ7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abca16E9PWJ7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abca16E9PWJ7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abca16E9PWJ7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abca16E9PWJ7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abca16E9PWJ7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abca16E9PWJ7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abca16E9PWJ7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abca16E9PWJ7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abca16E9PWJ7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abca16E9PWJ7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abca16E9PWJ7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abca16E9PWJ7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abca16E9PWJ7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms