Protein–RNA interactions for Protein: E2JF22

Piezo1, Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Piezo1E2JF22 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Piezo1E2JF22 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms