Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms