Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BC035044E0CXF8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BC035044E0CXF8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BC035044E0CXF8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC035044E0CXF8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC035044E0CXF8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BC035044E0CXF8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC035044E0CXF8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC035044E0CXF8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC035044E0CXF8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC035044E0CXF8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC035044E0CXF8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC035044E0CXF8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC035044E0CXF8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC035044E0CXF8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC035044E0CXF8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BC035044E0CXF8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BC035044E0CXF8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC035044E0CXF8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms