Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1V9

Defa28, Defensin, alpha, 28, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa28D3Z1V9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms