Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
3425401B19RikD3Z1D3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms