Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc6D3YZP9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms