Protein–RNA interactions for Protein: D3YYW9

1500009C09Rik, RIKEN cDNA 1500009C09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1500009C09RikD3YYW9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
1500009C09RikD3YYW9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
1500009C09RikD3YYW9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
1500009C09RikD3YYW9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
1500009C09RikD3YYW9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
1500009C09RikD3YYW9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
1500009C09RikD3YYW9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
1500009C09RikD3YYW9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms