Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc170D3YXL0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms