Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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BC048679D3YXE9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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BC048679D3YXE9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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BC048679D3YXE9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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BC048679D3YXE9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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BC048679D3YXE9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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BC048679D3YXE9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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BC048679D3YXE9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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BC048679D3YXE9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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BC048679D3YXE9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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BC048679D3YXE9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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