Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms