Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nxpe3B9EKK6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nxpe3B9EKK6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nxpe3B9EKK6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nxpe3B9EKK6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nxpe3B9EKK6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nxpe3B9EKK6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nxpe3B9EKK6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nxpe3B9EKK6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nxpe3B9EKK6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nxpe3B9EKK6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nxpe3B9EKK6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nxpe3B9EKK6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nxpe3B9EKK6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nxpe3B9EKK6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nxpe3B9EKK6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nxpe3B9EKK6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nxpe3B9EKK6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nxpe3B9EKK6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nxpe3B9EKK6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nxpe3B9EKK6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nxpe3B9EKK6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nxpe3B9EKK6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nxpe3B9EKK6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nxpe3B9EKK6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nxpe3B9EKK6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nxpe3B9EKK6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nxpe3B9EKK6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nxpe3B9EKK6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nxpe3B9EKK6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nxpe3B9EKK6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nxpe3B9EKK6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nxpe3B9EKK6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nxpe3B9EKK6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nxpe3B9EKK6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nxpe3B9EKK6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nxpe3B9EKK6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nxpe3B9EKK6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nxpe3B9EKK6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nxpe3B9EKK6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nxpe3B9EKK6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nxpe3B9EKK6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nxpe3B9EKK6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nxpe3B9EKK6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms