Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmf1B9EKI3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmf1B9EKI3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
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