Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms