Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cped1B2RX70 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cped1B2RX70 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cped1B2RX70 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cped1B2RX70 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cped1B2RX70 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cped1B2RX70 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cped1B2RX70 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cped1B2RX70 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cped1B2RX70 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cped1B2RX70 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cped1B2RX70 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cped1B2RX70 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cped1B2RX70 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cped1B2RX70 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cped1B2RX70 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cped1B2RX70 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cped1B2RX70 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cped1B2RX70 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cped1B2RX70 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cped1B2RX70 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cped1B2RX70 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cped1B2RX70 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cped1B2RX70 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cped1B2RX70 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms