Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms