Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apba1B2RUJ5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms