Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms