Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms