Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc22a28B2RT89 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms