Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms