Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms