Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trabd2bB1ATG9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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