Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms