Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms