Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF7

Plcb2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb2A3KGF7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plcb2A3KGF7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms