Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms