Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms