Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms