Protein–RNA interactions for Protein: A2BI40

Xlr4a, X-linked lymphocyte-regulated 4A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4aA2BI40 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xlr4aA2BI40 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xlr4aA2BI40 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xlr4aA2BI40 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xlr4aA2BI40 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xlr4aA2BI40 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xlr4aA2BI40 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Xlr4aA2BI40 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xlr4aA2BI40 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xlr4aA2BI40 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms