Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms