Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms