Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Frmpd1A2AKB4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms