Protein–RNA interactions for Protein: A2AIR5

Grin3a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3aA2AIR5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Grin3aA2AIR5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin3aA2AIR5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin3aA2AIR5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin3aA2AIR5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin3aA2AIR5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin3aA2AIR5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin3aA2AIR5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin3aA2AIR5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin3aA2AIR5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin3aA2AIR5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin3aA2AIR5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin3aA2AIR5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin3aA2AIR5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin3aA2AIR5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin3aA2AIR5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin3aA2AIR5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin3aA2AIR5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin3aA2AIR5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms