Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms