Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms