Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms