Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms