Protein–RNA interactions for Protein: A2A6A1

Gpatch8, G patch domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpatch8A2A6A1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gpatch8A2A6A1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gpatch8A2A6A1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gpatch8A2A6A1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gpatch8A2A6A1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gpatch8A2A6A1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gpatch8A2A6A1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gpatch8A2A6A1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gpatch8A2A6A1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gpatch8A2A6A1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gpatch8A2A6A1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gpatch8A2A6A1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gpatch8A2A6A1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gpatch8A2A6A1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gpatch8A2A6A1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gpatch8A2A6A1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gpatch8A2A6A1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gpatch8A2A6A1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Gpatch8A2A6A1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gpatch8A2A6A1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gpatch8A2A6A1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Gpatch8A2A6A1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gpatch8A2A6A1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gpatch8A2A6A1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gpatch8A2A6A1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gpatch8A2A6A1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gpatch8A2A6A1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gpatch8A2A6A1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gpatch8A2A6A1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gpatch8A2A6A1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gpatch8A2A6A1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gpatch8A2A6A1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Gpatch8A2A6A1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Gpatch8A2A6A1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gpatch8A2A6A1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gpatch8A2A6A1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Gpatch8A2A6A1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gpatch8A2A6A1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gpatch8A2A6A1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gpatch8A2A6A1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gpatch8A2A6A1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gpatch8A2A6A1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gpatch8A2A6A1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gpatch8A2A6A1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms