Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Trav12-2A0N8N6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Trav12-2A0N8N6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Trav12-2A0N8N6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Trav12-2A0N8N6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Trav12-2A0N8N6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Trav12-2A0N8N6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Trav12-2A0N8N6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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