Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms