Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV74

Asb1, Ankyrin repeat and SOCS box protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asb1Q9WV74 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Asb1Q9WV74 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Asb1Q9WV74 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Asb1Q9WV74 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Asb1Q9WV74 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Asb1Q9WV74 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Asb1Q9WV74 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Asb1Q9WV74 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Asb1Q9WV74 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Asb1Q9WV74 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Asb1Q9WV74 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Asb1Q9WV74 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Asb1Q9WV74 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Asb1Q9WV74 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Asb1Q9WV74 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Asb1Q9WV74 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Asb1Q9WV74 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Asb1Q9WV74 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Asb1Q9WV74 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Asb1Q9WV74 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Asb1Q9WV74 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Asb1Q9WV74 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Asb1Q9WV74 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Asb1Q9WV74 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Asb1Q9WV74 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Asb1Q9WV74 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Asb1Q9WV74 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Asb1Q9WV74 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Asb1Q9WV74 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Asb1Q9WV74 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Asb1Q9WV74 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Asb1Q9WV74 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Asb1Q9WV74 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Asb1Q9WV74 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Asb1Q9WV74 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Asb1Q9WV74 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Asb1Q9WV74 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Asb1Q9WV74 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Asb1Q9WV74 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Asb1Q9WV74 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Asb1Q9WV74 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Asb1Q9WV74 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Asb1Q9WV74 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Asb1Q9WV74 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Asb1Q9WV74 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Asb1Q9WV74 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Asb1Q9WV74 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Asb1Q9WV74 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Asb1Q9WV74 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Asb1Q9WV74 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Asb1Q9WV74 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Asb1Q9WV74 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Asb1Q9WV74 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Asb1Q9WV74 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Asb1Q9WV74 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Asb1Q9WV74 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Asb1Q9WV74 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Asb1Q9WV74 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Asb1Q9WV74 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Asb1Q9WV74 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Asb1Q9WV74 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Asb1Q9WV74 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Asb1Q9WV74 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Asb1Q9WV74 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Asb1Q9WV74 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Asb1Q9WV74 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Asb1Q9WV74 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Asb1Q9WV74 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Asb1Q9WV74 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Asb1Q9WV74 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Asb1Q9WV74 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Asb1Q9WV74 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Asb1Q9WV74 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Asb1Q9WV74 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Asb1Q9WV74 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Asb1Q9WV74 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Asb1Q9WV74 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Asb1Q9WV74 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Asb1Q9WV74 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Asb1Q9WV74 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Asb1Q9WV74 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Asb1Q9WV74 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Asb1Q9WV74 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Asb1Q9WV74 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Asb1Q9WV74 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Asb1Q9WV74 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Asb1Q9WV74 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Asb1Q9WV74 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Asb1Q9WV74 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Asb1Q9WV74 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Asb1Q9WV74 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Asb1Q9WV74 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Asb1Q9WV74 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Asb1Q9WV74 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Asb1Q9WV74 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Asb1Q9WV74 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Asb1Q9WV74 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Asb1Q9WV74 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Asb1Q9WV74 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Asb1Q9WV74 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms