Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI4

Slc13a1, Solute carrier family 13 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc13a1Q9JHI4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc13a1Q9JHI4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc13a1Q9JHI4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc13a1Q9JHI4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc13a1Q9JHI4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc13a1Q9JHI4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc13a1Q9JHI4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc13a1Q9JHI4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc13a1Q9JHI4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc13a1Q9JHI4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc13a1Q9JHI4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc13a1Q9JHI4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc13a1Q9JHI4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc13a1Q9JHI4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc13a1Q9JHI4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc13a1Q9JHI4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc13a1Q9JHI4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc13a1Q9JHI4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc13a1Q9JHI4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc13a1Q9JHI4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc13a1Q9JHI4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc13a1Q9JHI4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc13a1Q9JHI4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc13a1Q9JHI4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc13a1Q9JHI4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc13a1Q9JHI4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc13a1Q9JHI4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc13a1Q9JHI4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc13a1Q9JHI4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc13a1Q9JHI4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc13a1Q9JHI4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc13a1Q9JHI4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc13a1Q9JHI4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc13a1Q9JHI4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc13a1Q9JHI4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc13a1Q9JHI4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc13a1Q9JHI4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc13a1Q9JHI4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc13a1Q9JHI4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc13a1Q9JHI4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc13a1Q9JHI4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc13a1Q9JHI4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc13a1Q9JHI4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc13a1Q9JHI4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc13a1Q9JHI4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc13a1Q9JHI4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc13a1Q9JHI4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc13a1Q9JHI4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc13a1Q9JHI4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc13a1Q9JHI4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc13a1Q9JHI4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc13a1Q9JHI4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc13a1Q9JHI4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc13a1Q9JHI4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc13a1Q9JHI4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc13a1Q9JHI4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc13a1Q9JHI4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc13a1Q9JHI4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc13a1Q9JHI4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Slc13a1Q9JHI4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Slc13a1Q9JHI4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc13a1Q9JHI4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc13a1Q9JHI4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc13a1Q9JHI4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc13a1Q9JHI4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc13a1Q9JHI4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc13a1Q9JHI4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc13a1Q9JHI4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc13a1Q9JHI4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc13a1Q9JHI4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc13a1Q9JHI4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc13a1Q9JHI4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc13a1Q9JHI4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc13a1Q9JHI4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc13a1Q9JHI4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc13a1Q9JHI4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc13a1Q9JHI4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc13a1Q9JHI4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc13a1Q9JHI4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc13a1Q9JHI4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc13a1Q9JHI4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc13a1Q9JHI4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc13a1Q9JHI4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc13a1Q9JHI4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc13a1Q9JHI4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc13a1Q9JHI4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc13a1Q9JHI4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc13a1Q9JHI4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc13a1Q9JHI4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc13a1Q9JHI4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc13a1Q9JHI4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc13a1Q9JHI4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc13a1Q9JHI4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc13a1Q9JHI4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc13a1Q9JHI4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc13a1Q9JHI4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc13a1Q9JHI4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slc13a1Q9JHI4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slc13a1Q9JHI4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc13a1Q9JHI4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms