Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C6

Med11, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med11Q9D8C6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Med11Q9D8C6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Med11Q9D8C6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Med11Q9D8C6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Med11Q9D8C6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Med11Q9D8C6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Med11Q9D8C6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Med11Q9D8C6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Med11Q9D8C6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Med11Q9D8C6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Med11Q9D8C6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Med11Q9D8C6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Med11Q9D8C6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Med11Q9D8C6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Med11Q9D8C6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Med11Q9D8C6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Med11Q9D8C6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Med11Q9D8C6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Med11Q9D8C6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Med11Q9D8C6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Med11Q9D8C6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Med11Q9D8C6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Med11Q9D8C6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Med11Q9D8C6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Med11Q9D8C6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Med11Q9D8C6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Med11Q9D8C6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Med11Q9D8C6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Med11Q9D8C6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Med11Q9D8C6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Med11Q9D8C6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Med11Q9D8C6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Med11Q9D8C6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med11Q9D8C6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med11Q9D8C6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med11Q9D8C6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med11Q9D8C6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med11Q9D8C6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Med11Q9D8C6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Med11Q9D8C6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Med11Q9D8C6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Med11Q9D8C6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Med11Q9D8C6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Med11Q9D8C6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Med11Q9D8C6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Med11Q9D8C6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Med11Q9D8C6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Med11Q9D8C6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Med11Q9D8C6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Med11Q9D8C6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Med11Q9D8C6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Med11Q9D8C6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Med11Q9D8C6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Med11Q9D8C6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Med11Q9D8C6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Med11Q9D8C6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Med11Q9D8C6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Med11Q9D8C6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Med11Q9D8C6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Med11Q9D8C6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Med11Q9D8C6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Med11Q9D8C6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Med11Q9D8C6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Med11Q9D8C6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Med11Q9D8C6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Med11Q9D8C6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Med11Q9D8C6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Med11Q9D8C6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Med11Q9D8C6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Med11Q9D8C6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Med11Q9D8C6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Med11Q9D8C6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Med11Q9D8C6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Med11Q9D8C6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Med11Q9D8C6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Med11Q9D8C6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Med11Q9D8C6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Med11Q9D8C6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Med11Q9D8C6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Med11Q9D8C6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Med11Q9D8C6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med11Q9D8C6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med11Q9D8C6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med11Q9D8C6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Med11Q9D8C6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Med11Q9D8C6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Med11Q9D8C6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med11Q9D8C6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med11Q9D8C6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med11Q9D8C6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med11Q9D8C6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med11Q9D8C6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Med11Q9D8C6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Med11Q9D8C6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Med11Q9D8C6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Med11Q9D8C6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Med11Q9D8C6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Med11Q9D8C6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Med11Q9D8C6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Med11Q9D8C6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms